Kościół Św. Mikołaja należy do najstarszych gdańskich kościołów. Niedaleko od jego dzisiejszego umiejscowienia stał już w XII wieku kościół o takim imieniu. Początek budowy dzisiejszego kościoła datowany jest na rok 1348.

W obecnym budynku znajduje się wiele oryginalnych zarówno barokowych jak i rokokowych dzieł sztuki sakralnej oraz posiadające 35 rejestrów organy, oprawione we wspaniały prospekt pochodzący z roku 1755-go.
Kościół Św. Mikołaja jest jedynym kościołem na terenie starego miasta Gdańska który przetrwał Drugą Wojnę Światową bez większych uszkodzeń.